本项目属于现代农业技术领域家畜遗传育种学科，解析了下丘脑—垂体—性腺轴主要生物学通路上28个繁殖相关基因在14个绵羊品种中的多态性及其与小尾寒羊产羔数的遗传联系，发现BMPRIB、BMP15和GDF9可能是影响小尾寒羊高繁殖力的主效基因。解析了下丘脑—垂体—性腺轴主要生物学通路上33个繁殖相关基因在20个山羊品种中的多态性及其与济宁青山羊产羔数的遗传联系，发现BMP15可能是影响济宁青山羊高繁殖力的主效基因以及金堂黑山羊高繁殖力可能由FSHR异源二聚体引起。应用抑制消减杂交技术构建了济宁青山羊和辽宁绒山羊初配适龄和成年期下丘脑、垂体、卵巢6个正向消减cDNA文库，以及幼年期、初情期、初情期同龄对照间下丘脑、垂体、卵巢—子宫、肾上腺12个正向消减cDNA文库，从基因多态、组织表达谱、差异表达等方面探讨了BMPRIB、BMP15、GDF9、MTNR1A、KiSS1、GPR54、Lin28B等基因与济宁青山羊高繁殖力、常年发情和性早熟的遗传联系。采用分子生物学和生物信息学等手段和方法，对小尾寒羊高繁殖力、常年发情以及济宁青山羊高繁殖力、常年发情和性早熟性状开展了系统深入的研究，筛选并鉴定了一批与羊优良繁殖性状密切相关的基因和分子标记。制定了农业行业标准《绵羊多胎主效基因FecB分子检测技术规程》，对11 376只绵羊进行了FecB突变检测，建立了绵羊FecB突变分子检测方法及小尾寒羊多羔核心群和肉用多羔绵羊核心群，构建了分子标记辅助育种体系，该标准已被北京、河北、山东、江苏、宁夏、新疆等省区市8个单位应用于绵羊多羔育种实践，产生了显着的经济效益和社会效益。项目实施期间，发表学术论文155篇（其中SCI收录论文37篇），总被引用507次（总被他引371次）。获得国家授权发明专利3项，制定农业行业标准1项。本成果总体达到国际先进水平，其中BMP15、GDF9基因突变对山羊高繁殖力的遗传影响，以及MTNR1A基因突变与济宁青山羊性早熟的遗传联系研究为国内外首次报道，研究水平居国际领先。