采用先进的病毒学技术，以我国H5N1禽流感病毒为研究模型，针对H5禽流感病毒进化、跨宿主感染哺乳动物及致病力分子机制等国际前沿问题，开展基础理论的探索性研究。发现我国水禽及候鸟携带H5禽流感病毒在自然进化过程中形成复杂的基因型，不同基因型病毒随着时间推移获得对哺乳动物的感染、致病能力，彻底否定以往对哺乳动物感染和致病力与特定基因型相关的观点。发现PB2基因对H5禽流感病毒跨宿主感染哺乳动物起决定作用，PB2基因701位点谷氨酰胺是禽流感病毒具感染哺乳动物能力的关键分子标记。发现NS1基因是影响H5禽流感病毒致病力的关键因素，并在影响动物感染性和致病力方面存在宿主种间差异，揭示一系列NS1基因与致病力相关位点，并阐明这些位点的变化如何影响致病力的分子机制。