以与病原感染、识别和免疫调节有关的分子——猪细胞因子和Toll样受体家族等分子为研究对象，在国内首次通过不同组织细胞、诱导培养策略，成功建立高通量的细胞因子等基因家族的筛选、克隆和发现的技术平台，克隆鉴定了猪白介素、干扰素和Toll样受体家族等基因13个，其中IL-18、 CD58、 GM-CSF、TLR2和TLR9基因以及1个未知功能基因为国内首次克隆，并分析探讨了这些分子成员间和物种间基因及其推导蛋白质组成的遗传演化关系以及所具有的结构与生物学功能的关系；构建了猪IL - 2、 IL - 4、 IL-6、 IL-18、 γ-IFN以及CD58等基因的原核（大肠杆菌）和或真核（酵母、动物细胞）重组表达载体及其细胞株，成功地建立了表达（重组蛋白）或扩增(重组质粒）、分离和纯化技术平台；在国内外率先创制了猪IL-4、 IL-6、 γ-IFN以 及CD58基因重组质粒新制剂作为猪口蹄疫、猪囊虫病、猪瘟等重大疫病疫苗的免疫调节剂，率先创制重组猪α-IFN和γ-IFN新制剂作为抗口蹄疫病毒、猪瘟病毒以及抗肿瘤的生物制品，并进行了临床试验性研究，为安全、高效疫苗和药物的设计提供了新的思路和材料；在国内首次研制了猪IL-4、IL-6、α-IFN和γ-IFN重组细胞因子的单克隆抗体及其ELBA诊断检测试剂盒，为细胞因子作用机理的研究和应用开发奠定了基础。其中有7项产品已批准进入转基因生物安全评价阶段，有3项国家发明专利已公开。研究成果整体达到同类研究的国内领先和国际先进水平。