本项目由农业科学农业资源与农业区划研究所组织皖、赣、浙、闽、湘、鄂、豫等9家单位，以冬闲田削减、化肥减施、耕地质量提升、清洁稻米生产为主要目标，开展了长达8年的大规模联合试验研究和示范，形成适应现代农业需要的稻区绿肥-水稻高产高效清洁生产的完整技术体系。主要进展如下：
　　1.抢救性梳理、挖掘和丰富了我国绿肥作物种质资源。引进、整理和评价种质资源1500多份次，初步建立了稻田绿肥作物种质资源库。定向选育了7个紫云英新品种。
　　2.突破了限制稻田绿肥作物发展的关键技术瓶颈。在绿肥作物多样性种植、水稻机械收割留高茬迟播紫云英、紫云英轻简高效播种及管理和翻压、绿肥作物专用肥料及根瘤菌、绿肥与稻草碳氮互济、绿肥-水稻肥料运筹、紫云英生产沼气、紫云英种子生产与加工等技术方面取得创新和进展。
　　3.组装集成了我国稻区绿肥-水稻高产高效清洁生产技术体系。建立了一系列稻田绿肥生产利用技术规程，形成了以提升水稻高产稳产能力的绿肥生产利用技术、基于绿肥作物生产利用的清洁稻米生产养分管理技术为核心的南方稻田冬绿肥-水稻高产高效清洁生产利用技术体系。
　　4.明确了绿肥在南方现代水稻生产中的贡献及作用机制。研究指出了绿肥种植翻压可以替代20%～40%的化肥用量，水稻产量提升10%以上。通过剖析30年定位试验，证明绿肥提升水稻生产能力的主要机制是为水稻生长发育创造了良好的土壤物理、化学、生物环境。
　　该项目发表论文80篇，出版着作4部。制订绿肥相关技术规程13项、地方标准2项。获得新品种认定7个、新产品登记3个、专利授权3项。培训农技人员和农户2万多人次。4年累计示范及推广面积24.7万多公顷，增产稻谷13.4万多吨，增效4.3亿多元；节约氮磷钾肥2.0万多吨（折纯）；生物固氮约1.1万多吨、固碳94万吨。