以茶树种质资源保存保护为基础，开展了茶树资源的收集、保存、整理、编目、鉴定评价、标准化数据库的建立、优异资源的发掘利用研究，主要成果包括：1）修订了茶组植物分类系统，基本摸清了中国茶树资源的家底和地理分布特点。2）新收集国内外各类茶树资源1544份，入圃保存资源达3012份，收集保存了茶组植物的所有种和变种，使我国成为世界上保存茶树资源多样性最丰富的国家。3）按照统一的描述标准和数字化表达手段，整理、整合了国内3200余份茶树资源，构建了茶树种质资源信息平台。4）建立起由一系列标准、规程等组成的茶树种质资源鉴定评价技术平台，对1520份资源进行了系统鉴定评价；在国内率先利用RAPD、ISSR和EST-SSR分子标记开展种质鉴定、遗传多样性和遗传结构研究，从表型和分子水平明确了中国茶树资源遗传多样性的空间分布和遗传结构特点。5）提出了茶树核心种质构建策略，构建了包含360份资源、遗传代表性80%以上的核心种质。6）发掘了30份优异茶树种质，创制出20份农艺、品质或抗性等性状得到改良的茶树新种质。
　　近五年来，向40多家科研、教学、推广及生产部门分发资源840余份次，提供的茶树种质资源被广泛用于育种、基础研究、教学、新产品开发等领域。利用本项目提供的优异种质为亲本，共获得优良株系120多个，新品系40余个，培育新品种15个，申报新品种保护权17个，获得新品种保护权4个。本项目制定的技术规程、标准等已经被国内外茶树种质资源研究人员和单位广泛采用，特别是茶树DUS测试指南成为UPOV成员国共同遵循的国际规则。