该项目针对我国1989年、1994年、2007年和2008年由马流感病毒H3N8亚型引起的马流感疫情而开展研究工作，主要有四方面的内容。
　　1、从我国各地发生的马流感疫情中分离到十二株马流感病毒流行株并进行了鉴定，是我国至今保存最完整的马流感病毒库，为深入研究我国乃至全球的马流感提供了丰富及宝贵的材料。
　　2、通过对分离毒株的测序并与其它马流感病毒流行株的比对，阐明了我国自1989年至今马流感分离株的进化关系，在我国尚属首次。本研究不仅阐述了我国马流感病毒的起源与进化演化关系，而且明确了我国马流感病毒与其它国家马流感病毒的关系等，为今后监测我国马流感疫情的动态奠定了基础。
　　3、建立了一系列马流感病原学和血清学诊断技术，为马流感疫情监测，马流感病毒的分离与鉴定、产地马流感检疫、口岸出口马属动物检疫及无特定疫病区的建立等提供了技术保障。
　　4、选择具有代表性的马流感病毒流行株作为疫苗株开展马流感灭活疫苗的研究，在我国尚属首次，是继我所马传贫疫苗之后的第二个马病疫苗。同时开展具有我国自主知识产权的禽痘病毒载体马流感疫苗以及DNA疫苗的研制工作，拓宽了国内马属动物新型疫苗的研究领域。