经分析发现一批基因和蛋白在日本血吸虫不同发育阶段及雌，雄虫不同性别虫体呈差异表达。获得了272个日本血吸虫期别和297个血吸虫性别差异表达基因信息及93个日本血吸虫差异表达蛋白信息，其中新发现基因(EST)38个。深入开展血吸虫抗原基因功能研究，克隆了23个含ORF的血吸虫抗原基因，其中SjGCP，SjTSP2，SjTEGF，Sj314C10，SjIF5，Sj423，SjWnt4和Sj21.7等8个基因为首次报道，应用家蚕细胞和酵母表达了3个新基因，构建了3种含目的基因的DNA疫苗。在小鼠和绵羊等动物10多批基因工程和多价疫苗免疫试验基础上，开展了血吸虫天然宿主水牛免疫试验，初步试验结果表明,研制的三价重组抗原苗和单价基因重组抗原苗分别诱导了73.84％和50.15％的减虫率及84.34％和55.99％的粪便孵化毛蚴减少率，提示这两种疫苗都有很大的研究潜力和发展潜力。
　　应用RNAi技术在体内外试验发现,日本血吸虫雄虫差异表达基因SjGCP的表达状况影响了血吸虫雌雄虫的合抱。首次在国内外明确某种基因可影响血吸虫雌雄虫的合抱，首次在动物体内实现利用RNAi技术成功干扰血吸虫基因功能。
　　本研究结果为揭示血吸虫的生长发育机制，研制开发抗血吸虫病疫苗和新治疗药物，开拓血吸虫病防治新途径提供了重要基础，具有重要的理论意义和实际意义。采用的技术方法和策略已被在国内相关实验室借鉴应用于球虫，猪蛔虫等重要寄生虫的功能基因组学研究。分离，鉴定的一些重要血吸虫功能基因或蛋白，已被应用于开展生物学功能的深入研究，包括评估其作为血吸虫候选疫苗或药物靶标的潜力。