通过远缘杂交、突变体诱导、系统选育等常规育种方法与现代生物技术结合，打破了天然彩色棉色泽与产量、品质的负相关，选育出了高产、色泽稳定、适宜机纺的棕絮1号、绿絮1号、棕263、棕128、棕3-944等16个天然彩色棉新品种（系），开创了我国现代彩色棉生产发展的先河，促成了我国首批彩色棉纺织品的加工和利用。育成了国际上第一例、拥有自主知识产权的国审转BT基因抗虫彩色棉新品种中棉所51，以及棕B2K8、棕970818、绿G88、棕S9B12等10多个转BT基因抗虫彩色棉新种质。中棉所51、棕S9B12、棕970818的衣分从28%提高到36.0％—39.5%；棕S9B12的绒长为32.0毫米，比强度为33.5cN/tex，麦克隆值为4.3，达到了中长绒棉的标准；杂交棉棕970818的纤维品质接近长绒棉的标准；棕B2K8为深棕色，其皮棉产量达到了白色棉推广品种水平。上述材料的绒长、比强度比美国彩色棉分别提高了2.5—6.3毫米、5—10.2cN/tex。建立了“研究院所＋企业+农户”的彩色棉产业化发展模式，实现了科研、生产、加工和市场营销一体化，推动了彩色棉产业的发展。在河南、河北、新疆、山东等地建立了彩色棉繁育和生产基地，累计种植彩色棉60多万亩，生产彩棉4.3万吨，节本增效2.03亿元。此外，转BT基因抗虫彩色棉的推广，增加产量3％—5%，减少农药用量60.0%—80.0%，经济、社会、生态效益显着。