农田面源氮磷流失引起的水环境污染日益引起社会关注。但因缺乏全国尺度的核算方法、规范可行的监测技术和长期系统的科学监测，一直难以准确把握我国农田面源污染底数与流失规律，也难以提出针对性减排策略。项目历经十三年努力，创建了集监测、减排于一体的全国农田面源污染监测网络平台，积累了我国唯一的国家尺度的面源污染数据资源，在检测方法、流失规律和减排技术等方面取得了重大突破：

　　创建了农田面源氮磷流失核算方法与检测技术体系。首次建立了以分区分类为指导、以种植模式为单元的全国农田面源氮磷流失核算方法，自主研发了农田氮磷流失监测技术体系并制定了6项技术规范，构建了以北京为核心、覆盖全国31个省得农田面源氮磷流失监测网络平台并实现了同步联网观测，成为世界首个国家尺度的农田面源污染监测平台，推动了我国农田面源污染研究基础设施的建设，引领了全国科研队伍的发展。

　　基本查清了全国农田面源氮磷流失底数与规律，对我国农田面源污染有了全新的认识。全国农田氮、磷年均流失量分别为176.8万吨和11.6万吨，流失强度为17.0 kg N/hm2和1.11 kg P/hm2，仅占当年氮、磷施肥量的4.92%和1.10%，远低于以往估测值；黄淮海平原等高度集约化农区是我国农田面源污染防治的重点区域；粮田污染较轻，稻田甚至对周边水体有净化功能；菜田污染突出，以占全国8%的农田面积贡献了全国24%和21%的氮、磷流失量；面源污染的本底效应突出，仅三分之一源于当年施肥；同一模式不同监测点、同一检测点不同年际间差异明显，证实了全国同步联网、长期监测至关重要。部分成果已有国务院、农业部对外发布。

　　揭示了北京平原农区地下水硝酸盐污染特征及成因。北京平原农区地下水硝酸盐含量平均5.74 mg L-1，超标21.0%；地下水位越浅，硝酸盐污染越严重；过量灌溉施肥尤为突出的集约化菜区污染最重。农田氮磷流失是地下水硝酸盐污染的重要原因。

　　提出了“节水治标、控肥治本，节水控肥、标本兼治”的农田面源污染防控新理念。揭示了各项农艺措施的减排效果和作用机制，创建了农田面源污染最佳农艺减排技术体系，全国累计推广1.8亿亩，节约氮、磷化肥59.6万吨和54.5万吨，减少氮、磷流失69066吨和2736吨。其中北京推广210万亩，减少氮流失3441吨，节水1.5亿立方米。

　　研究所获授权专利17项，软着17项，技术规范7项，培训127万人次。成果对提升全国面源污染防治能力，推动节水农业发展，建设资源节约型、环境友好型社会具有重大理论和实践价值。