进入21世纪后，全国共有1700多个大豆新品种通过国家和省级审定。全国各地大豆高产示范田均实现了亩产180-200公斤的产量，黄淮海多次出现实收亩产超过300公斤的高产典型，最高产量达到349.2公斤。南方地区也培育了一批适宜间套作种植的大豆新品种和鲜食大豆品种，西北灌区的中黄35创造了亩产421.37公斤的我国大豆单产最高纪录。

　　大豆分子标记辅助育种技术研究方面，已挖掘出一批与生育期、蛋白质含量、脂肪含量、抗病虫性、抗旱耐淹性、抗倒伏、荚粒数等相关的性状位点（QTL），在大豆结荚习性、耐盐耐旱基因克隆、养分高效利用研究方面，获得了一批在世界上居于领先地位的成果。