国家农作物种质保存中心是由农业部于1999年3月立项批准建设，总投资2600万元，2000年12月开工，2002年11月落成投入使用。总建筑面积3500 m2，由种质保存区、前处理加工区和研究试验区三部分组成。保存区建设面积：1700 m2，包括17间冷库，其中5间为长期库，使用面积合计293 m2，9间为中期库，使用面积合计568 m2，3间临时库(每间使用面积36m2)。长期库的贮藏温度-18℃±2℃，相对湿度≤50%，保存容量为20万份以上，用于长期保存全国农业植物种质资源，包括农家种、育成品种和近缘野生材料等。中期库贮藏温度-4℃±2℃，相对湿度≤50%，保存容量为40万份以上，中期库保存种质材料可随时供种分发给国内育种、科研和教学等单位使用，同时也供国际交换使用。3间临时存放冷库（＋4℃）供种子临时存放使用。前处理加工区主要由种子接纳室、发芽室、干燥室、“双十五”干燥室、称重室、包装室组成。“国家农作物种质保存中心”保存设施投入使用后，加上原有的国家库长期库的40万份容量，则总保存容量达到百万份以上，基本满足30年内我国发展的需要，同时也将使得国家种质库保存的种质资源能为我国作物育种和生产发挥更大的作用。