国家柑桔品种改良中心由农业部国债项目投资1000万元于2002年开始建设，目前已建成并投入运行。中心拥有研究人员29人（其中高级职称9人），有高标准的实验室1000平方米，配备了完善的柑桔遗传育种和分子生物学等研究所需仪器设备；拥有现代化的育种圃250亩（包括育种材料保存圃、杂交育种圃、砧木育种圃、新品种展示园和新品种繁育圃等），智能化温网室2000多平方米。
　　中心主要开展柑桔引种、选种、杂交育种、基因工程育种和航天育种，培育具有自主知识产权的柑桔（含砧木）优新品种；开展柑桔遗传育种相关领域的基础和应用基础研究，创新育种技术；开发和利用分子标记、转基因产品和检测技术；为全国柑桔产区提供技术服务，推广新品种和配套生产技术。目前拥有选种、杂交育种、辐射育种和生物技术育种材料近千份。
　　本中心主要任务及提供的服务：
　　1、收集、保存和评价国内外具有育种价值的特异种质、选种材料和育种材料。
　　2、进行杂交育种、辐射育种、选种、基因工程和细胞工程育种、倍性育种实践，根据柑桔生产需要和市场变化不断培育出优良柑桔和砧木新品种。
　　3、不断引进国外优良品种进行观察、选育，获得适合我国栽培的新品种。
　　4、跟踪国际前沿，进行分子标记、基因组作图、基因定位和克隆等高层次的应用基础研究，并及时将其应用于育种实践中。
　　5、接受生产单位委托，对柑桔优新品种进行大批量离体快繁，进行抗溃疡病、抗缺铁及其它特殊性状的基因工程定向改良。
　　6、建立新品种繁育体系，向省（市、区）级柑桔苗木繁育基地（场）供应优良新品种种源，并帮助其建立良种苗木繁育体系；未建省级繁育基地的柑桔生产省（市、区）则直接提供良种苗木或接穗，加速我国柑桔生产良种化进程。
　　7、为各省（市）提供技术服务，进行良种配套技术培训。
　　8、为政府和农业行政部门制订有关柑桔良种苗木生产和流通的法规性文件，提供技术咨询。